产品信息
对于 CUT&RUN 实验,我们建议在使用前添加 2 μl Proteinase K (20 mg/ml) #10012 和 0.5 μl RNAse A (10 mg/ml) #7013 到 197.5 μl CUT&RUN DNA Extraction Buffer(每份输入样本 200 μl)中。然后在 55°C 下与 100 μl 细胞悬液孵育 1 小时,摇晃,以提取基因组 DNA。
与染色质免疫沉淀 (ChIP) 检测一样,核酸酶靶向切割和释放 (CUT&RUN) 是一项用于在细胞天然染色质环境下检测蛋白-DNA 相互作用的强大通用技术 (1-4)。CUT&RUN 提供了一种检测细胞中蛋白-DNA 相互作用的快速、可靠且真正的低细胞数测定法。与 ChIP 实验不同,CUT&RUN 不存在甲醛交联、染色质碎裂和免疫沉淀,使之成为一种使蛋白-DNA 相互作用富集和检测靶基因的更快且更有效的方法。CUT&RUN 可在一天之内完成从活细胞到纯化 DNA 的过程,且经证明每次检测只需使用少至 500-1,000 个细胞 (1,2)。和 ChIP 中碎裂所有细胞染色质不同,CUT&RUN 利用一种染色质抗体靶向消化方法,从而使背景信号比 ChIP 实验低得多。因此,CUT&RUN 仅需 ChIP-seq 检测所需测序深度的 1/10 (1,2)。最后,加入简单的 Spike-in DNA 即可准确定量和标准化靶标蛋白结合,而这是 ChIP 方法无法实现的。这种方法可有效标准化样品间和实验间的信号。
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